本文于2010年发表在《Clinical Chemistry》杂志上。
利用母体血液中的胎儿DNA进行21-三体的产前诊断是当前的重点研究对象,本文给出了一种结合遗传标记与胚胎特异的表观遗传标记的检验方法。用亚硫酸盐测序法在胎盘与母体血细胞中寻找在21号染色体上不同甲基化情况的标记。然后用甲基化敏感性限制性内切酶消化继之以微流控数字PCR分析来研究检出的标记。染色体剂量分析以比较表观遗传标记与X染色体上的锌指蛋白基因(ZFX)或Y染色体上的锌指蛋白基因(ZFY)进行。推定的HLCS(holocarboxylase synthetase,羧化全酶合成酶)基因启动子在胎盘高甲基化,在母体血细胞中低甲基化。分析结果显示,在整倍体与21-三体之间,HLCS与RASSF1A阳性结果数目比值有显著性差异(P=0.005,Mann-Whitney秩和检验),HLCS与ZFY的阳性结果数目比值也有显著性差异(P<0.001,Mann-Whitney秩和检验)。高甲基化的HLCS和ZFY基因座的染色体剂量比较能够区别出21-三体和整倍体胎盘DNA。分析了整倍体胎儿的母亲血浆24例与21-三体胎儿的母亲血浆5例。除了1例以外全部的整倍体样本都被正常地分类。结论是由于特异性的标志物充足,大规模人群覆盖应该容易达到,从而表观遗传学的染色体剂量分析有相当的作为21-三体的非侵入性产前诊断手段的潜力。